Raja Jaafar Baginda dilahirkan pada 26 September 1941 di Hospital Taiping dan mendapat pendidikan menengah di Anderson School, Ipoh sebelum melanjutkan pengajian di Universiti Malaya, dengan ijazah, Ijazah Kesenian pada tahun 1965. Baginda menyertai Setiausaha Negeri Perak pada tahun 1966 dan bertugas dengan Pejabat Tanah dan Daerah sehingga 1971. Baginda kemudiannya melanjutkan pengajiannya pada peringkat Master dalam Pentadbiran Awam di Universiti Cornell, Ithaca NY, pada tahun 1975.

Raja Nor Mahani binti Almarhum Raja Shabar Shah (dilahirkan pada. 18 Oktober 1942 di Hospital Kuala Lumpur).